All’interno della Cattedrale vi è la cripta a tre navate, cui si accede attraverso una ripida scaletta. Dopo diverse ricostruzioni, fu riedificata definitivamente nel 1614. In quell’occasione i corpi dei nove protettori della città furono riposti in arche. Tra questi anche il corpo di Omobono Tucenghi, mercante cremonese dichiarato santo un anno dopo la sua morte, patrono di Cremona. Le sue reliquie, riposte inizialmente in un sarcofago realizzato nel 1614, sono oggi collocate in un’urna dietro l’altare a lui dedicato. Da allora la cripta è luogo di devozione da parte dei cremonesi. Il giorno dedicato al santo è il 13 novembre.